Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nop56Q9D6Z1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nop56Q9D6Z1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nop56Q9D6Z1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms