Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc3Q9D6Y1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Ccdc3Q9D6Y1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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