Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ptp4a3Q9D658 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ptp4a3Q9D658 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms