Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc83Q9D4V3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms