Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pus10Q9D3U0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pus10Q9D3U0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms