Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rufy3Q9D394 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rufy3Q9D394 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms