Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snrnp35Q9D384 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snrnp35Q9D384 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms