Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Batf3Q9D275 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms