Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Mrpl53Q9D1H8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms