Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rfc5Q9D0F6 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rfc5Q9D0F6 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms