Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PmpcbQ9CXT8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PmpcbQ9CXT8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms