Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atg3Q9CPX6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atg3Q9CPX6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms