Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Ssxb1Q9CPU1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ssxb1Q9CPU1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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