Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Smim3Q99PE5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms