Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sf3b1Q99NB9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sf3b1Q99NB9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms