Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ubqln4Q99NB8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ubqln4Q99NB8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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