Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnaja3Q99M87 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnaja3Q99M87 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnaja3Q99M87 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Dnaja3Q99M87 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Dnaja3Q99M87 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms