Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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PtprtQ99M80 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PtprtQ99M80 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms