Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk5rap3Q99LM2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk5rap3Q99LM2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms