Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TriobpQ99KW3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms