Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
PpifQ99KR7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms