Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ciao1Q99KN2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms