Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip1Q922J3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip1Q922J3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms