Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Odf3Q920N1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Odf3Q920N1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Odf3Q920N1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Odf3Q920N1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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