Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpm2Q91YD4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpm2Q91YD4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms