Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ccdc115Q8VE99 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ccdc115Q8VE99 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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