Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rdh10Q8VCH7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rdh10Q8VCH7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms