Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Nup58Q8R332 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup58Q8R332 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms