Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hpf1Q8CFE2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hpf1Q8CFE2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hpf1Q8CFE2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hpf1Q8CFE2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hpf1Q8CFE2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Hpf1Q8CFE2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hpf1Q8CFE2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Hpf1Q8CFE2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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