Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc17Q8CE13 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc17Q8CE13 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms