Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc63Q8CDV6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc63Q8CDV6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ccdc63Q8CDV6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc63Q8CDV6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms