Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lrif1Q8CDD9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms