Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nrip1Q8CBD1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nrip1Q8CBD1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms