Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Parp9Q8CAS9 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Parp9Q8CAS9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Parp9Q8CAS9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Parp9Q8CAS9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Parp9Q8CAS9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Parp9Q8CAS9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms