Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dclre1bQ8C7W7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Dclre1bQ8C7W7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms