Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933409G03RikQ8C5U0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933409G03RikQ8C5U0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms