Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8C5C9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms