Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppfia2Q8BSS9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ppfia2Q8BSS9 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms