Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tmem260Q8BMD6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tmem260Q8BMD6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms