Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGD6

Slc38a9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, mousemouse

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Length 560 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a9Q8BGD6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a9Q8BGD6 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a9Q8BGD6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms