Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htatsf1Q8BGC0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms