Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.4Q85ZW8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms