Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Smim19Q80ZU4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms