Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cracr2bQ80ZJ8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms