Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Avl9Q80U56 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Avl9Q80U56 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Avl9Q80U56 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms