Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf8Q80TJ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms