Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ95

Lnpk, Endoplasmic reticulum junction formation protein lunapark, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LnpkQ7TQ95 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LnpkQ7TQ95 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms