Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Prrc2bQ7TPM1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Prrc2bQ7TPM1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms