Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sbno2Q7TNB8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms