Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf139Q7TMV1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf139Q7TMV1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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